La philosophie enseignée dans le Shōrinji Kempō vient du Kongo Zen, la philosophie du diamant (on utilise cette image du diamant car il a cette qualité d'être éclatant et indestructible). Elle favorise le développement de l'individu et affirme que chacun ne doit puiser sa force (physique et mentale/spirituelle) qu'en lui-même. Les techniques martiales pratiquées dans le Shōrinji Kempō peuvent être dangereuses, voire mortelles. Le kenshi doit donc se maîtriser pour maîtriser les techniques qui lui sont enseignées, et c'est pour cette raison que le Shōrinji Kempō fait référence à des préceptes Bouddhistes. Il y a six principes de base :

    Ken zen ichi nyo (拳褝一如?) : entraînement conjoint du corps et de l'esprit (unité de la technique et de la philosophie) ;

    Riki ai funi (力愛不二?) : harmonie indissociable de la force et de la compassion ;

    Shushu kōju (守主攻従?): priorité de la défense sur l'attaque ;

    Fusatsu katsujin (不殺活人?) : aider et construire au lieu de détruire ;

    Gōjū ittai (剛柔一体?) : unité du Goho et du Juho, c’est-à-dire parité des techniques dures et souples ;

    Kumite shutai (組手主体?) : la nécessité de s'entraîner à deux afin de progresser ensemble.

Pendant l'entraînement, les professeurs insistent sur le fait que le but du Shorinji Kempo n'est pas de créer des "guerriers", mais de former des individus capables de comprendre et d'aider les autres.

Pour que le Shōrinji Kempō ne soit pas qu'un simple ensemble de techniques de combat, l'enseignement philosophique est indispensable.