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Na verdade a tensão de entrada, vai direto para o transformador, que tem a função de "subir" a voltagem para o Magnetron, ou seja:

O que é ligado a rede, é o transformador e o magnetrom recebe a tensão da rede através da indução do transformador, portanto ele não é ligado direto a rede!

Pode ser que o transformador é que esta em curto, mas a também um pequeno transformador da placa de controle, que neste caso "desce" a tensão para os sensíveis componentes da placa de controle, não sei no caso do "Panasonic", mas na maioria dos micro-ondas, antes deste transformador de baixa, a um "Termistor" que tem a função de "proteger" o transformador de baixa, e as vezes ele não "abre", mas entra em curto e isso pode sim também queimar o fusível principal.

Você tem ai trez possíveis causas da queima deste fusível, mas pode descartar o Magnetron.

Espero ter ajudado.