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Si riceve per appuntamento è più corretto perché per serve ad indicare il tramite, il mezzo, mentre su sta ad indicare la posizione ovvero è un sinonimo di sopra ovviamente anche in senso figurato.

Si riceve su appuntamento

su. Ma qual è va senza apostrofo.

su appuntamento

Si riceve solo per appuntamento.

SU

È più corretto dire "Si riceve su appuntamento".