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O HD interno fica dentro do computador e o externo fora :)

Mas falando sério...

O HD externo oferece mobilidade (dá até para se carregar no bolso) com grande capacidade de armazenamento (em contraste com os pendrives atuais) entretanto perde em velocidade de acesso (devido à velocidade do USB 2.0) quando comparado aos internos (a não ser que o externo utilize USB 3.0, Firewire ou eSATA).

Quanto aos programas, você pode optar pelas versões "portable" que permitem ser instaladas ou descompactadas diretamente dentro de um hd externo ou pendrive e executados de lá, com isto você poderá executar os programas mesmo em outras máquinas além da sua (como em lan-houses, por exemplo, onde a velocidade da conexão à internet é melhor).

A versão portátil do Limewire você poderá baixar em:

http://www.baixaki.com.br/download/portable-limewi...

E alternativas portáteis ao Nero em:

http://www.baixaki.com.br/busca.asp?q=nero+portabl...

Tem mais aqui:

http://www.superdownloads.com.br/materias/selecao-...

Uma das diferenças é o preço mas vale a pena ter um externo mas confiavel e vc leva para onde quizer

http://wwwcasaeletro.com.br/

nao pq usar sistema operacional no externo nao tem como , somente pra guardar grd e todo tipo de arquivo , e o melhor é q vc nao perde como o interno

O HD é o mesmo, e sua funcionalidade é a mesma também, independente de ser externo ou interno, eu tenho um HD externo e alterno sempre entre um e outro.

E quanto à baixar arquivos de programas: o que importa é que ele esteja em um dos HD's é isso que importa. Beijos e espero ter ajudado!!!

Sim, é só você instalar um operacional no HD Externo, dai você usa ele da mesma forma que a HD interno.