Veja bem, vou te responder com experiência própria, já passei por isso pois quase todas as pessoas que fazem musculação sentem alguma dor localizada em algum momento, e eu já senti exatamente dor no ombro e com esses exercícios que você está falando. Olha pode ser tendinite pois aparece quando há movimentos repetitivos e com muita carga e pelo que você falou que parece ser na junta, mas resta saber se é realmente uma dor na junta ou articulações como você falou ou se é só uma dor muscular pois aí é diferente. Nesses casos geralmente o que melhora é ficar uma ou duas semanas fora dos exercícios ou fazê-los realmente com muita pouca carga pois se continuar e com muito peso pode ter certeza que não vai melhorar e ainda pode piorar, se ficar nesse período de repouso quando for voltar, volte devagar com pouco peso e vá aumentando devagar pois senão pode voltar a sentir as dores. Bom, estou te dando uma sugestão de um caso que aconteceu comigo e que agi dessa forma para melhorar mas realmente se as dores persistirem mesmo assim sugiro que procure o ortopedista para avaliar o que pode ser de fato pois não tem como ter certeza do que você tem, mas pelos sintomas está me parecendo muito uma tendinite.

Espero ter ajudado. Abraço!

Consultando um Médico do Desporto, Ortopedista ou Fisiatra, que lhe examinará, talvez peça algum Exame Complementar e lhe prescreverá os procedimentos necessários,que podem inclusive ser repouso, calor, exercícios leves e/ou específicos; vc tem que ser EXAMINADO !